Transfusio posiada także dział kontroli jakości, który w sposób uporządkowany dba o przestrzeganie zasad krwiolecznictwa, analizuje niepożądane zdarzenia oraz prowadzi ustawiczne kontrole i audyty, których wyniki i analizy przedstawia Dyrektorowi szpitala.
Lekarz odpowiedzialny za gospodarkę krwią współpracuje ze specjalistą kontroli jakości, a sam także uczestniczy w kontrolach i analizach, co przekłada się w sposób bezpośredni na świadomość w jakich obszarach powinien zwiększyć swoją aktywność.